Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFDQ9GZP0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms