Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms