Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB1Q9BVT8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB1Q9BVT8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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