Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms