Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms