Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQB6

VKORC1, Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VKORC1Q9BQB6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VKORC1Q9BQB6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms