Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms