Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TREX2Q9BQ50 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms