Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms