Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOL4Q9BPW4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms