Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP8Q99708 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms