Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MEIS3Q99687 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms