Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRBNQ96SW2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms