Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC38A2Q96QD8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms