Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms