Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1AQ96P16 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms