Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00167Q96N53 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms