Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC41A2Q96JW4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms