Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms