Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms