Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTERF3Q96E29 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTERF3Q96E29 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms