Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms