Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC1Q96C34 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms