Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG2BQ96BY7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG2BQ96BY7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms