Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms