Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms