Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-CQ95604 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms