Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP133Q8WUM0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms