Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSH3Q8TE77 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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