Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms