Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00301Q8NCQ3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms