Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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DTX3Q8N9I9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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DTX3Q8N9I9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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DTX3Q8N9I9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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DTX3Q8N9I9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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DTX3Q8N9I9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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DTX3Q8N9I9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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DTX3Q8N9I9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DTX3Q8N9I9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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