Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC17Q8N6Y2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC17Q8N6Y2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC17Q8N6Y2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC17Q8N6Y2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC17Q8N6Y2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC17Q8N6Y2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC17Q8N6Y2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRC17Q8N6Y2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms