Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGSF1Q8N6C5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms