Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP2Q8IXW5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP2Q8IXW5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms