Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC83Q8IWF9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms