Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP13Q86W25 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms