Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms