Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms