Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms