Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms