Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms