Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C16orf54Q6UWD8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms