Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DUX4L9Q6RFH8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DUX4L9Q6RFH8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms