Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms