Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNS3Q68CZ2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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TNS3Q68CZ2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNS3Q68CZ2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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