Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms