Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM236Q5W0B7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM236Q5W0B7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM236Q5W0B7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM236Q5W0B7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM236Q5W0B7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM236Q5W0B7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM236Q5W0B7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM236Q5W0B7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms