Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SUSD4Q5VX71 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms