Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms